Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trex2Q9R1A9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trex2Q9R1A9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms