Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Tmed2Q9R0Q3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmed2Q9R0Q3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmed2Q9R0Q3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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