Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SrpxQ9R0M3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SrpxQ9R0M3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms