Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Wdr54Q9R0D8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Wdr54Q9R0D8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms