Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nr4a3Q9QZB6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nr4a3Q9QZB6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms