Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phtf1Q9QZ09 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phtf1Q9QZ09 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms