Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pkp3Q9QY23 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pkp3Q9QY23 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms