Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK9

Sh2d2a, SH2 domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d2aQ9QXK9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sh2d2aQ9QXK9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh2d2aQ9QXK9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms