Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Limd1Q9QXD8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Limd1Q9QXD8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Limd1Q9QXD8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms