Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Hdgfl3Q9JMG7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms