Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Rabgef1Q9JM13 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rabgef1Q9JM13 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rabgef1Q9JM13 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rabgef1Q9JM13 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rabgef1Q9JM13 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Rabgef1Q9JM13 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rabgef1Q9JM13 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rabgef1Q9JM13 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Rabgef1Q9JM13 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Rabgef1Q9JM13 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rabgef1Q9JM13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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