Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chrac1Q9JKP8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chrac1Q9JKP8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms