Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pole3Q9JKP7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pole3Q9JKP7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms