Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nectin1Q9JKF6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nectin1Q9JKF6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms