Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ybx3Q9JKB3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ybx3Q9JKB3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms