Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Herpud1Q9JJK5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Herpud1Q9JJK5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms