Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccl28Q9JIL2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl28Q9JIL2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl28Q9JIL2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl28Q9JIL2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccl28Q9JIL2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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