Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ppp1r3fQ9JIG4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms