Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Exosc9Q9JHI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Exosc9Q9JHI7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms