Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf13bQ9ET35 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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