Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zcchc17Q9ESX4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zcchc17Q9ESX4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zcchc17Q9ESX4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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