Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem27Q9ESG4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem27Q9ESG4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms