Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Tlr1Q9EPQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr1Q9EPQ1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr1Q9EPQ1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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