Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Swt1Q9DBQ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Swt1Q9DBQ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Swt1Q9DBQ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms