Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrpraQ9DBG7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrpraQ9DBG7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms