Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot8Q9D8X5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cnot8Q9D8X5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms