Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slx4ipQ9D7Y9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slx4ipQ9D7Y9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms