Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chmp5Q9D7S9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chmp5Q9D7S9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms