Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp4cQ9D7F7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp4cQ9D7F7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp4cQ9D7F7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms