Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cmtm5Q9D6G9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm5Q9D6G9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms