Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fsip1Q9D3V5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fsip1Q9D3V5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms