Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rufy3Q9D394 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rufy3Q9D394 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rufy3Q9D394 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms