Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Creb3l4Q9D2A5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Creb3l4Q9D2A5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms