Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9D1F3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D1F3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms