Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NubplQ9CWD8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NubplQ9CWD8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms