Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rdm1Q9CQK3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdm1Q9CQK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdm1Q9CQK3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms