Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700029P11RikQ9CQ68 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
1700029P11RikQ9CQ68 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms