Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Use1Q9CQ56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Use1Q9CQ56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Use1Q9CQ56 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Use1Q9CQ56 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Use1Q9CQ56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Use1Q9CQ56 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Use1Q9CQ56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Use1Q9CQ56 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Use1Q9CQ56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms