Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med21Q9CQ39 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Med21Q9CQ39 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms