Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rassf3Q99P51 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rassf3Q99P51 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms