Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q99LU8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q99LU8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q99LU8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q99LU8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q99LU8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q99LU8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q99LU8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99LU8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99LU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99LU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q99LU8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms