Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf2Q99LE6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms