Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnajb11Q99KV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnajb11Q99KV1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms