Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2aQ99KJ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn2aQ99KJ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms