Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hps4Q99KG7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms