Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok1Q922Q2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok1Q922Q2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok1Q922Q2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms