Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clip1Q922J3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clip1Q922J3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms