Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp3Q91W36 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp3Q91W36 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms