Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt25Q8VCW2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt25Q8VCW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms