Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SdsQ8VBT2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SdsQ8VBT2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms